臨床上碘伏和高錳酸鉀的使用范圍不同，但二者都具有殺菌的功效。碘伏多用于皮膚消毒，是比較常見的消毒劑，一般對皮膚沒有刺激性。而高錳酸鉀具有一定的腐蝕性和刺激性，多用于漂白和氧化。

高錳酸鉀和碘伏作用范圍并不一致，碘伏具有廣譜殺菌作用，可殺滅細菌繁殖體，真菌，原生動物和一些病毒。高錳酸鉀溶液對此類作用比較弱。另外，碘伏是生活中最常用的消毒劑，使用安全，對皮膚沒有刺激性。而高錳酸鉀溶液是通過強氧化作用起到的消毒作用，具有刺激性和腐蝕性。